Su Calle de Toledo si erge l’imponente chiesa che fu costruita nel 1622-1633 come parte integrante del collegio dei Gesuiti, il Colegio Imperial, voluta da Mariana de Austria, moglie di Filippo IV, che lasciò all’ordine una cospicua eredità. La chiesa venne dedicata a San Isidro, per volere di Carlo III che ruppe i rapporti con i Gesuiti nel 1767, e i cui resti con quelli della moglie sono qui tumulati dal 1769, dopo essere stati rimossi dalla non lontana Capilla de San Isidro.
La chiesa di San Isidro è inoltre stata la cattedrale provvisoria di Madrid dal 1886 al 1993, anno della consacrazione di Nuestra Señora de la Almudena.
